Le fonds du musée est constitué, d'une part, par les saisies révolutionnaires de 1793, auprès des communautés religieuses et des nobles émigrés. Le musée est ouvert en 1799 (figure dans l'arrêté consulaire de 1801 concernant la création de quinze musées départementaux). De très nombreux dépôts de l'Etat ont enrichi les collections depuis lors, ainsi que diverses donations, au cours des XIXe et XXe siècles. Une politique d'acquisition menée depuis une quarantaine d'années complète l'enrichissement des collections.