Le musée est installé près d'un site gallo-romain majeur, le long du Rhin entre Augs et Strasbourg. Depuis 1960, des fouilles ponctuelles, des sondages et des projections sont à l'origine de collections importantes. En 1988, la commune demande la création d'un musée afin d'assurer la pérennité des collections. Le musée est inauguré en 1990.